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全血總RNA提取方法

作者:新景實驗室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標(biāo)注出處和本文鏈接

1. 紅細胞裂解液的稀釋:根據(jù)處理血液樣品的體積選取適當(dāng)體積的10×紅細胞裂解液(例如待處理的血液樣品體積為200 μl,則取140 μl 10×紅細胞裂解液),用RNase-free ddH2O 稀釋至1×紅細胞裂解液。 

2. 體積人類全血中加倍體積1×紅細胞裂解液(需自備合適的干凈管子)。 注意:為獲得最佳的混勻效果,血液和1×紅細胞裂解液的混合液體積不應(yīng)超過管子體積的3/4。如果血液中的白細胞含量較高,可按比例減小血液的使用體積,第步中的裂解液RL的使用體積也要進行相應(yīng)調(diào)整。 

3. 在冰上孵育10-15 分鐘,在孵育過程中渦旋振蕩混勻次。 

注意:在孵育的過程中溶液將變成半透明狀態(tài),表明紅細胞裂解。如果必要的話, 孵育時間可延長至20 分鐘。 

4. 4 2,100rpm (~400×g)離心10 分鐘,將上清完全去除。 

注意:離心后白細胞可能會形成小球,確保完全去除上清,痕量紅細胞的存在, 會使白細胞小球呈現(xiàn)紅色,而該現(xiàn)象會在隨后的漂洗步驟中消失。 

5. 向白細胞沉淀中加入1×紅細胞裂解液(加入1×紅細胞裂解液的體積是第步中全血用量的倍),重懸細胞。 

6. 4,2,100rpm (~400×g)離心10 分鐘,將上清完全去除。 

注意:如果上清去除不完全將會影響裂解及隨后的RNA 與膜的結(jié)合,導(dǎo)致最后 RNA產(chǎn)率降低。 

7. 向白細胞沉淀中加入裂解液RL(使用前請加入β-巰基乙醇),具體加量按照下表進行,渦旋或使用移液器混勻。 

注:如果血液不是健康人的全血,需要根據(jù)血液中白細胞的數(shù)量來確定所需裂解 RL的體積,此時細胞應(yīng)完全裂解,塊狀細胞沉淀消失。 

8. 將溶液轉(zhuǎn)移至過濾柱CS 中(過濾柱CS 放在收集管中),12,000 rpm (~13,400×g )離心分鐘,棄去過濾柱CS,收集濾液。 

注意:為避免氣溶膠的形成,請將移液器調(diào)整到≥750μl以保證一次性將所有溶液轉(zhuǎn)移到過濾柱上,如果細胞太多,將會出現(xiàn)裂解液粘稠的現(xiàn)象,造成難以吸取的情況。 

9. 向濾液中加入倍體積70%乙醇(通常為350μ600μl),混勻(此時可能會出現(xiàn)沉淀),得到的溶液和沉淀一起轉(zhuǎn)入吸附柱CR2 中(吸附柱CR2 放入收集管中),12,000 rpm(~13,400×g )離心30-60 秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2 放回收集管中。 

注意:配制70%乙醇時請使用RNase-free ddH2O,如果濾液體積有所損失,請 相應(yīng)減少70%乙醇用量。將溶液和沉淀轉(zhuǎn)移至吸附柱CR2 時,體積大于吸附柱 容量,可以分兩次完成。 

10. 向吸附柱CR2 中加入350 μ去蛋白液RW1,12,000 rpm(~13,400×g)離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2 放回收集管中。 

11. DNase I 工作液的配制:取10 μl DNase I 儲存液放入新的RNase-free 離心管

中,加入70 μl RDD 溶液,輕柔混勻。 

12. 向吸附柱CR2 中央加入80 μDNase I 工作液,室溫放置15 分鐘。

 13. 向吸附柱CR2 中加入350 μ去蛋白液RW1,12,000 rpm(~13,400×g)離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2 放回收集管中。 

14. 向吸附柱CR2 中加入500 μl漂洗液RW (使用前請先檢查是否已加入乙醇),室溫靜置分鐘,12,000 rpm(~13,400×g)離心30-60 秒,倒掉收集管中的廢液,將吸附柱CR2 放回收集管中。 

15. 重復(fù)步驟14。 

16. 12,000 rpm(~13,400×g)離心分鐘,倒掉廢液。將吸附柱CR2 置于室溫放置數(shù)分鐘,以徹底晾干吸附材料中殘余的漂洗液。 

注意:此步驟目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,離心后將吸附柱CR2 在室 溫放置片刻,以充分晾干。如果有漂洗液殘留,可能會影響后續(xù)的RT等實驗。 

17. 將吸附柱CR2 轉(zhuǎn)入一個新的RNase-free 離心管中,加入30-50 μl RNase-free ddH2O 室溫放置分鐘,12,000 rpm(~13,400×g)離心分鐘,得到RNA 溶液。 注意:洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于30 μl,體積過小影響回收效率。RNA溶液請于 -70保存。