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從火龍果中提取RNA

作者:新景實驗室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標(biāo)注出處和本文鏈接


 

實驗?zāi)康模?/span>

從火龍果果肉中提取RNA

實驗材料:新鮮的火龍果、研缽、植物果肉總RNA試劑盒(Simgen,Cat.No.5102050、植物總RNA提取試劑盒(SimgenCat.No.5101050。

實驗方法:

本次實驗嘗試用Simgen的植物果肉總RNA試劑盒和植物總RNA提取試劑盒兩種方法來提取RNA。

植物果肉總RNA試劑盒提取步驟:

1. 1.5 ml 離心管稱取500 mg火龍果果肉,加入200 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLP,研磨棒研磨至組織完全溶解,再補加300 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLP,使最終加入Buffer RLP的總體積為500 μl。混勻后13000 rpm 離心2分鐘;

*由于火龍果果肉容易破碎,本實驗采用研磨棒磨碎果肉。

3. 吸取≤ 700 μl的離心上清到過濾柱中,離心取濾液;

4.向濾液中加入700 μl 70%乙醇,混勻后700 μl混合液加入到核酸純化柱中,離心去濾液;

5. 剩余的混合液加入到核酸純化柱中,再次離心濾液;

6. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WBR過柱洗滌;

7. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;

8. 將核酸純化柱置于一個潔凈的RNase-free1.5 ml離心管中,用50 μl RNase-Free Water洗脫RNA;

9. 在微量紫外分光光度計上測量RNA的濃度;

10. 瓊脂糖凝膠電泳。

植物總RNA提取試劑盒提取步驟:

1. 離心管稱取100 mg火龍果果肉,加入100 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLC研磨棒研磨至組織完全溶解,,再補加500 μl 已加入β-巰基乙醇的Buffer RLC,使最終加入Buffer RLC的總體積為600 μl。 

*由于火龍果果肉容易破碎,本實驗采用研磨棒磨碎果肉。

2. 將組織的溶解物全部轉(zhuǎn)移到過濾柱中,離心取濾液;

3. 向濾液中加入600 μl 70%乙醇,混合后取600 μl混合液加入到核酸純化柱中,離心濾液;

4. 將剩余的混合液加入到核酸純化柱中,再次離心濾液;

5. 依次用500 μl Buffer WA600 μl Buffer WBR過柱洗滌;

6. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇

7. 將核酸純化柱置于一個潔凈的RNase-free1.5 ml離心管中,用50 μl RNase-Free Water洗脫RNA

8. 在微量紫外分光光度計上測量RNA的濃度;

9. 瓊脂糖凝膠電泳。

 

實驗結(jié)果:

1. 在微量紫外分光光度計上用RNase-Free Water調(diào)零,測量洗脫下來的RNA,結(jié)果如下:

 simgen-果肉總RNA試劑盒-植物總RNA試劑盒-洗脫下來的RNA測量表



1、2是用植物果肉總RNA試劑盒純化獲得的總RNA;3、4是用植物總RNA提取試劑盒純化獲得的總RNA

2. 1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl提取到的RNA,電泳20 min,結(jié)果如下:
simgen-果肉總RNA試劑盒-植物總RNA試劑盒-電泳圖


 

 

討論與分析

1.從結(jié)果上分析Simgen的植物果肉總RNA試劑盒和Simgen植物總RNA提取試劑盒都能提取到火龍果果肉RNA。

2.Simgen植物果肉總RNA試劑盒能夠提取的樣本量植物總RNA提取試劑盒的5倍,因此提取到的RNA濃度更高。

    植物RNA的提取過程經(jīng)常是Trizol試劑使用者的噩夢,究其原因,無一例外是因為植物組織中多糖(特別是淀粉類物質(zhì))衍生物的干擾:因為Trizol試劑中所含的硫氰酸胍遇到多糖類物質(zhì)便凝結(jié)成膠凍狀,阻止了RNA的進一步釋放。當(dāng)植物組織含有大量水分(比如果肉)時,就是多糖加RNA含量低的雙重阻撓了——這時候選用Simgen果肉總RNA試劑盒提取RNA確實是省時省力的好辦法。

 

 

 

                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         Simgen實驗室