自從上次“實測快速通用型基因組DNA提取試劑盒的性能”文章發(fā)布后,已經(jīng)有很多客戶向我們申請了試用裝,使用的反饋效果也不錯。其中某生物科技有限公司更是做了多家試劑盒的測試對比,接下來小新就將該公司測試的結(jié)果分享給大家,畢竟產(chǎn)品自測的效果難免讓人懷疑有做廣告的嫌疑,第三方的測試才會顯得公平公正。
一、 實驗材料
試劑盒:**贊(DC112-01)、**金(EE101-01)、*根(KG203)、新景(3105005)、*為(CW2298M)
樣本:小鼠肌肉、豬血、大腸桿菌(DH5α)、夾竹桃葉片
二、 實驗方法
1. 樣本處理:
A. 小鼠肌肉:稱取20 mg,液氮研磨成粉;
B. 豬血:取200 μl全血;
C. 大腸桿菌(DH5α):1.5 ml菌液離心取細(xì)菌沉淀;
D. 夾竹桃葉片:稱取100 mg,液氮研磨成粉。
2. 按照各試劑盒說明書操作,提取DNA。
3. 用超微量分光光度計測量提取的DNA,并進(jìn)行電泳檢測和Qubit檢測。
三、 實驗結(jié)果
1. 超微量分光光度計測量結(jié)果如下:
2. 電泳檢測結(jié)果如下:
3.Qubit檢測結(jié)果如下:
四、 分析與討論
1. 從超微量分光光度計測量結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是**贊,豬血樣本提取效果最好的是**贊,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*為,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的是新景。
2. 從電泳結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是新景,豬血樣本提取效果最好的是**贊和新景,大腸桿菌樣本提取效果最好的是**贊,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的是新景。(*根試劑盒提取的樣本電泳均未顯示條帶,但濃度高的原因是該試劑盒為快速樣品制備試劑盒,樣本裂解處理后DNA已經(jīng)降解成小片段,雖然可以直接用作qPCR檢測,但電泳已經(jīng)觀察不到DNA條帶。)
3. 從Qubit檢測結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是**贊,豬血樣本提取效果最好的是新景,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*為,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的是新景。
4. 三種檢測結(jié)果的差異性說明了分光光度計檢測方法的局限性,因為紫外吸光度測量不具有選擇性,無法區(qū)分DNA、RNA或蛋白質(zhì),同時一些游離核苷酸或多余的鹽離子也會影響檢測的數(shù)值。比如雖然從超微量分光光度計測量結(jié)果分析,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*為,但是電泳的結(jié)果卻是新景和*為的DNA條帶亮度差不多,**贊的DNA條帶反而更亮,并且*為提取的大腸桿菌DNA中污染有RNA。
5. 對比超微量分光光度計測量結(jié)果和Qubit檢測結(jié)果,可以發(fā)現(xiàn)新景和**金的試劑盒提取的DNA這兩者的檢測結(jié)果數(shù)值都很接近,差異比**贊和*為的試劑盒要小,說明新景和**金的試劑盒提取的DNA純度更高,RNA等雜質(zhì)的含量很少(電泳也能觀察到區(qū)別)。
市場上常見的通用性基因組DNA提取試劑盒(包括**贊、*為等公司)所采用的技術(shù)方案都是模仿QIAGEN的DNeasy Blood & Tissue Kit 產(chǎn)品,簡而言之就是蛋白酶K消化后加醇過柱,缺點是去除雜質(zhì)效率比較差,且容易殘留RNA。新景的快速通用型基因組DNA提取試劑盒則采用了全新獨創(chuàng)的分相后直接過柱技術(shù),不僅操作步驟更簡單,獲得的DNA純度更高,對復(fù)雜樣本(血液、植物、糞便)也能輕松應(yīng)對,必定會在不同廠家的通用型基因組DNA提取試劑盒競爭中脫穎而出。
·采用獨特的裂解液配合蛋白酶K消化各種不同類型的生物樣本·獨創(chuàng)的萃取技術(shù)快速去除生物樣本中的蛋白水解產(chǎn)物、脂類、多糖、酚衍生物、色素等雜質(zhì)·無需RNase A消化,特別設(shè)計的核酸純化柱能選擇性地吸附萃取水相中的大片段DNA,小片段核酸則被選擇性地濾過除去·僅需用一種洗液洗滌1-2次即可獲得多至25 μg的高純度基因組DNA 查看產(chǎn)品