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通用型基因組DNA試劑盒性能大比拼

作者:新景實驗室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標(biāo)注出處和本文鏈接

自從上次實測快速通用型基因組DNA提取試劑盒的性能文章發(fā)布后,已經(jīng)有很多客戶向我們申請了試用裝,使用的反饋效果也不錯。其中生物科技有限公司更是做了多家試劑盒的測試對比,接下來小新就將該公司測試的結(jié)果分享給大家,畢竟產(chǎn)品自測的效果難免讓人懷疑有做廣告的嫌疑,第三方的測試才會顯得公平公正。

 

 

一、 實驗材料

試劑盒:**贊(DC112-01)、**金(EE101-01)、*根(KG203)、新景(3105005)、*為(CW2298M

樣本:小鼠肌肉、豬血、大腸桿菌(DH5α)、夾竹桃葉片

 

二、 實驗方法

1. 樣本處理:

A. 小鼠肌肉:稱取20 mg,液氮研磨成粉;

B. 豬血:取200 μl全血;

C. 大腸桿菌(DH5α):1.5 ml菌液離心取細(xì)菌沉淀;

D. 夾竹桃葉片:稱取100 mg,液氮研磨成粉。

2. 按照各試劑盒說明書操作,提取DNA。

3. 用超微量分光光度計測量提取的DNA,并進(jìn)行電泳檢測和Qubit檢測。

 

三、 實驗結(jié)果

1. 超微量分光光度計測量結(jié)果如下:

快速通用型基因組DNA提取試劑盒-DNA提取超微量檢測結(jié)果

2. 電泳檢測結(jié)果如下:

快速通用型基因組DNA提取試劑盒-電泳檢測結(jié)果

快速通用型基因組DNA提取試劑盒-DNA提取電泳檢測結(jié)果

3.Qubit檢測結(jié)果如下:

快速通用型基因組DNA提取試劑盒-DNA提取QQubit濃度測定數(shù)據(jù)結(jié)果圖

四、 分析與討論

1. 從超微量分光光度計測量結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是**贊,豬血樣本提取效果最好的是**贊,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*為,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的新景。

2. 從電泳結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是新景,豬血樣本提取效果最好的是**贊和新景,大腸桿菌樣本提取效果最好的是**贊,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的新景。(*根試劑盒提取的樣本電泳均未顯示條帶,但濃度高的原因是該試劑盒為快速樣品制備試劑盒,樣本裂解處理后DNA已經(jīng)降解成小片段,雖然可以直接用作qPCR檢測,但電泳已經(jīng)觀察不到DNA條帶。)

3. Qubit檢測結(jié)果看,小鼠肌肉樣本提取效果最好的是**贊,豬血樣本提取效果最好的是新景,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*為,夾竹桃葉片樣本提取效果最好的新景。

4. 三種檢測結(jié)果的差異性說明了分光光度計檢測方法的局限性,因為紫外吸光度測量不具有選擇性,無法區(qū)分DNARNA或蛋白質(zhì),同時一些游離核苷酸或多余的鹽離子也會影響檢測的數(shù)值。比如雖然從超微量分光光度計測量結(jié)果分析,大腸桿菌樣本提取效果最好的是*,但是電泳的結(jié)果卻是新景和*為的DNA條帶亮度差不多,**贊的DNA條帶反而更亮,并且*提取大腸桿菌DNA中污染有RNA。

5. 對比超微量分光光度計測量結(jié)果和Qubit檢測結(jié)果,可以發(fā)現(xiàn)新景和**金的試劑盒提取的DNA這兩者的檢測結(jié)果數(shù)值都很接近,差異比**贊和*為的試劑盒要小,說明新景和**金的試劑盒提取的DNA純度更高,RNA等雜質(zhì)的含量很少(電泳也能觀察到區(qū)別)。

 

市場上常見的通用性基因組DNA提取試劑盒(包括**贊、*為等公司)所采用的技術(shù)方案都是模仿QIAGENDNeasy Blood & Tissue Kit 產(chǎn)品,簡而言之就是蛋白酶K消化后加醇過柱,缺點是去除雜質(zhì)效率比較差,且容易殘留RNA。新景的快速通用型基因組DNA提取試劑盒則采用了全新獨創(chuàng)的分相直接過柱技術(shù),不僅操作步驟更簡單,獲得的DNA純度更高,對復(fù)雜樣本(血液、植物、糞便)也能輕松應(yīng)對,必定會在不同廠家的通用型基因組DNA提取試劑盒競爭中脫穎而出。