一.實驗?zāi)康模?/strong>
從血凝塊中提取DNA。
二.實驗材料:
兩個血凝塊樣本、手術(shù)刀、血凝塊DNA純化試劑盒(Simgen,Cat.No.4201050)、2×Taq Plus PCR Master Mix(Simgen,Cat.No.7005100)、Human β-globin gene引物(Forward:TTAGGCCTTAGCGGGCTTAGAC;Reverse:CCAGGATTTTTGATGGGACACG)。
三.實驗方法:
本次實驗采用Simgen的血凝塊DNA純化試劑盒方法來提取血凝塊DNA,步驟如下:
1. 用手術(shù)刀切取300~400 mg血凝塊,轉(zhuǎn)移血凝塊到1.5 ml離心管中;
2. 根據(jù)血凝塊的體積(按1 mg =1 μl換算),補(bǔ)加Buffer PL至終體積為500 μl;
3. 加入20 μl蛋白酶K貯存液,再加入15 μl Buffer SP,旋渦振蕩約15秒混勻。
4. 56°C水浴15分鐘;
5. 加入375 μl Buffer L1,蓋上管蓋,旋渦振蕩30秒;
6. 加入375 μl Buffer L2,劇烈搖晃離心管3~5次,再旋渦振蕩30秒混勻。 13000 rpm 離心5分鐘;
7. 吸取750 μl離心上清液加入核酸純化柱中,離心去濾液;
8. 依次用500 μl Buffer WA和600 μl Buffer WB過柱洗滌;
9. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;
10.將核酸純化柱置于一個潔凈的1.5 ml 離心管中,用60 μl 56℃預(yù)熱的Buffer TE洗脫DNA;
11.在微量紫外分光光度計上測量DNA的濃度;
12.用2×Taq Plus PCR Master Mix擴(kuò)增Human β-globin gene,目的基因長約1.3kb。
13.瓊脂糖凝膠電泳。
四.實驗結(jié)果:
1.在微量紫外分光光度計上用Buffer TE調(diào)零,測量洗脫下來的DNA,結(jié)果如下:
2.在1%的瓊脂糖凝膠上,加入8 μl提取到的血凝塊基因組DNA,電泳20分鐘,結(jié)果如下:
M:DL15000 DNA Marker
1、2:血凝塊DNA
3.在1%的瓊脂糖凝膠上,加入5μl PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,電泳15分鐘,結(jié)果如下:
M:DL2000 DNA Marker
1:陽性對照擴(kuò)增產(chǎn)物
2、3:血凝塊DNA擴(kuò)增產(chǎn)物
五.實驗結(jié)論:
1.用Simgen血凝塊DNA純化試劑盒從約350mg血凝塊中提取到了約10μg DNA。DNA的純度很好,A260/A280接近1.8;鹽分殘留很低,A260/A230接近2.5。
2.基因組DNA電泳檢測顯示比較完整,拖尾較少,主帶明顯。
3.從血凝塊中提取到的基因組DNA用作模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,效果良好。
六.討論:
市場上大部分品牌的血凝塊DNA提取試劑盒在提取DNA前都需要將預(yù)先血凝塊研磨再提取DNA,操作極為不便,并且提取到的DNA有降解現(xiàn)象(見網(wǎng)址鏈接http://www.dxy.cn/bbs/topic/33224165?source=rss)。Simgen血凝塊DNA純化試劑盒由于采用了其專利技術(shù)(國家發(fā)明專利號: ZL 201410377744.5),可容忍血凝塊樣本在溶解不完全的前提下提取DNA,所以無需研磨步驟,只需用蛋白酶K消化血凝塊即可,操作起來相對而言非常簡便快速。