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Simgen SYBR Green PCR Mix的選擇

作者:新景實(shí)驗(yàn)室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請(qǐng)標(biāo)注出處和本文鏈接

近來有用戶反映Simgen2×SYBR Green PCR Mix7106100產(chǎn)品做PCR檢測,與某公司的SYBR Green Mix相比較,發(fā)現(xiàn)有CT值有增大的現(xiàn)象,這是為什么呢?

小編經(jīng)過深入研究,發(fā)現(xiàn)當(dāng)選用 2×SYBR Green PCR Mix 配合用戶的引物PCR檢測時(shí),CT值就與某公司的SYBR Green Mix幾乎一致了。原來2×SYBR Green PCR Mix7106100)是追求高特異性的產(chǎn)品;而2×SYBR Green PCR Mix 則是追求高靈敏度的產(chǎn)品--但是它對(duì)于引物的要求會(huì)比較高,如果引物設(shè)計(jì)得不好,在PCR的過程中,模板起始濃度較低時(shí)很容易出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,下面就讓小編給大家介紹一下這兩款產(chǎn)品的優(yōu)點(diǎn)及不足:

 

2×SYBR Green PCR Mix -兩款產(chǎn)品的優(yōu)缺點(diǎn)以及不足對(duì)比
下面是兩款產(chǎn)品實(shí)例測試:
 

PCR體系配置

2×SYBR Green PCR Mix 兩款產(chǎn)品實(shí)例測試: PCR體系配置
2
×SYBR Green PCR Mix的標(biāo)準(zhǔn)曲線 
2×SYBR Green PCR Mix的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖(圖1、圖2) 
 從上圖所述,2×SYBR Green PCR Mix7106100)的相關(guān)系數(shù)高達(dá)0.999,而且重復(fù)性高。

2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ(7107100)的標(biāo)準(zhǔn)曲線

2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ 的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖(左:低濃度模板;右:高濃度模板) 


2×SYBR Green PCR Mix Ⅱ(7107100)標(biāo)準(zhǔn)曲線圖 

從上圖所述,2×SYBR Green PCR Mix在高濃度模板時(shí),相關(guān)系數(shù)高達(dá)0.999,重復(fù)性高;但是引物設(shè)計(jì)不完美時(shí),一旦有低模板濃度,就會(huì)出現(xiàn)非特異擴(kuò)增,從而降低相關(guān)系數(shù)。

simgen-2×SYBR Green PCR Mix-溶解曲線圖  

CT值表

simgen-2×SYBR Green PCR Mix-CT值表
CT值表格及融解曲線看,可看出2×SYBR Green PCR MixⅡ在靈敏度上比2×SYBR Green PCR Mix7106100會(huì)高出0.5-1個(gè)CT值左右,但是在低濃度模板時(shí)(10
-7),2×SYBR Green PCR MixⅡ的CT值出現(xiàn)異常,這是因?yàn)樵谝镌O(shè)計(jì)的不是很好時(shí),2×SYBR Green PCR MixⅡ在低濃度模板時(shí)易出現(xiàn)非特異擴(kuò)增。  

綜上所述,2×SYBR Green PCR Mix7106100)的特異性比2×SYBR Green PCR Mix 高,但是在靈敏度上不如2×SYBR Green PCR Mix。所以倘若追求高特異性,小編推薦使用2×SYBR Green PCR Mix7106100,如果追求靈敏度,還是推薦使用2×SYBR Green PCR Mix

 

 

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