科研用戶(hù)最大的煩惱就是,和你取同一個(gè)樣本、做同樣研究工作的人太少了,導(dǎo)致在選擇試劑盒的時(shí)候找不到客觀(guān)、有價(jià)值的評(píng)測(cè)報(bào)告,于是最后同學(xué)們只能沿用師兄、師姐實(shí)驗(yàn)時(shí)采購(gòu)的試劑盒。然而沒(méi)有對(duì)比,就沒(méi)有傷害——一些品牌知名度較高的,使用效果卻不怎么樣的產(chǎn)品就這么一直默默地幸存下來(lái)了。今天我們就來(lái)實(shí)測(cè)比較一下SIMGEN和國(guó)內(nèi)知名大牌T**NGEN的高多糖多酚植物總RNA試劑盒之間的差異,選用的樣本是典型的提取RNA困難的樣本——馬鈴薯塊莖。
實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?/span>
對(duì)比SIMGEN和T**NGEN兩個(gè)品牌的高多糖多酚植物總RNA試劑盒的性能差異。
實(shí)驗(yàn)材料:
馬鈴薯塊莖、一次性手術(shù)刀、研缽
高多糖多酚植物總RNA試劑盒(SIMGEN Cat.No.5103050)、T**NGEN RNAprep PureRNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒(DP441)
超微量電子天平(DENVER INSTRUMENT,TP-213)
旋渦震蕩器(越新儀器,XH-C)
超微量分光光度計(jì)(SIMGEN Cat.No.sim100)
電泳儀(北京六一儀器廠(chǎng),DYY-6C型 )
實(shí)驗(yàn)方法:
由于馬鈴薯塊莖非常容易研碎,本次實(shí)驗(yàn)采用裂解液浸泡樣本研磨法破碎樣本后提取RNA,具體操作步驟如下:
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
1、在超微量分光光度計(jì)上分別用各自試劑盒的RNase-Free Water/ RNase-Free ddH2O調(diào)零,測(cè)量洗脫下來(lái)的RNA,結(jié)果如下:
1、2為SIMGEN高多糖多酚植物總RNA試劑盒的提取結(jié)果,3、4為T**NGEN RNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒的提取結(jié)果。
2、在1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl洗脫的RNA進(jìn)行電泳,結(jié)果如下:
分析與討論:
1. 實(shí)驗(yàn)最初T**NGEN的RNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒使用的裂解液是試劑盒中配備的裂解液SL,但是在研磨階段裂解液SL與馬鈴薯塊莖組織形成膠狀物沉淀,實(shí)驗(yàn)根本無(wú)法繼續(xù)進(jìn)行下去,與該品牌官網(wǎng)宣傳的“配有超強(qiáng)裂解能力的裂解液SL,僅需1小時(shí)即可從香蕉、西瓜、蘋(píng)果、梨等果肉,紅薯、馬鈴薯等塊莖,棉花……” 內(nèi)容嚴(yán)重不符。最后只好按照其說(shuō)明書(shū)上的描述所說(shuō)向T**NGEN公司索取了另一種裂解液HL來(lái)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。
2. 盡管更換了裂解液HL,但是從測(cè)得的濃度以及電泳條帶的亮度分析,T**NGEN的這款多糖多酚植物總RNA提取試劑盒只提取到了微量的RNA,差不多只有0.5 μg,提取效果與其網(wǎng)站上宣傳的效果仍然不符,頗有“學(xué)術(shù)造假”之嫌疑。而SIMGEN的高多糖多酚植物總RNA試劑盒則提取到了5.9 μg、12.9 μg的RNA,是T**NGEN試劑盒的10倍以上,而且條帶完整清晰,非常明亮,與分光光度計(jì)測(cè)得的濃度有很好的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
3. 馬鈴薯塊莖中含有大量淀粉,切開(kāi)后容易變褐色,是典型的高多糖多酚植物代表,因此我們有理由相信T**NGEN的RNAprep Pure多糖多酚植物總RNA提取試劑盒并不像其自己宣傳的那樣“專(zhuān)門(mén)針對(duì)多糖多酚等難提植物樣本獨(dú)特配置”,至少馬鈴薯塊莖樣本的提取效果就很不理想。而SIMGEN的高多糖多酚植物總RNA試劑盒提取馬鈴薯塊莖RNA則輕松過(guò)關(guān)。