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Simgen高多糖多酚植物總RNA試劑盒實(shí)測---閩楠葉片RNA的提取

作者:新景實(shí)驗(yàn)室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標(biāo)注出處和本文鏈接

某天跟客戶閑聊的時(shí)候,客戶突然提出了一個問題,“我們用T***gen的高多糖多酚試劑盒,通常洗脫體積30 μl,得到的RNA濃度也就100ng/μl,到200 ng/μl的時(shí)候很少,做反轉(zhuǎn)錄總會覺得不夠用,而且他們的試劑盒,研磨完加入裂解液,會變成特別粘稠的鼻涕狀,吸上清的時(shí)候特別費(fèi)勁”。

于是我們從客戶那邊要來了樣本,帶回公司進(jìn)行了研究。那么是否是因?yàn)楫a(chǎn)品的不同而產(chǎn)生的差異呢?接下來就讓我們通過實(shí)驗(yàn)來尋找答案吧。

一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>

從閩楠葉片中提取RNA。

二、實(shí)驗(yàn)材料:

新鮮閩楠葉片

研缽

高多糖多酚植物總RNA試劑盒Simgen,Cat.No. 5103050

DNase Ⅰ柱上消化試劑盒(Simgen,Cat.No. 8010050

三、實(shí)驗(yàn)方法

本次實(shí)驗(yàn)嘗試用高多糖多酚植物總RNA試劑盒和DNase Ⅰ柱上消化試劑盒(Simgen,Cat.No. 8010050)提取閩楠葉片RNA。

高多糖多酚植物總RNA試劑盒中插入DNase Ⅰ柱上消化試劑盒操作提取步驟

1. 在研缽中稱取200 mg植物組織,加入液氮,將組織研磨至粉末狀,再用液氮預(yù)冷的1.5 ml離心管稱取50 mg研磨成粉末狀的組織。

* 研磨組織時(shí)應(yīng)及時(shí)補(bǔ)加液氮,避免組織融化,以免內(nèi)源性的RNA酶恢復(fù)活性而降解RNA。

2. 加入600 μl已加入β-巰基乙醇的Buffer RCT,旋渦振蕩直至組織全部溶解。

3. 加入600 μl Buffer EX,用力混合均勻,12000 rpm離心5分鐘。

4. 小心吸取350 μl上清液,轉(zhuǎn)入一個潔凈的1.5 ml離心管中。

5. 在上清液中加入350 μl Buffer K并直接用吸頭吸注6-8次混合均勻,將混合液全部轉(zhuǎn)移到過濾柱中,蓋上管蓋,13000 rpm離心1分鐘。

6. 棄過濾柱,向?yàn)V液中加入700 μl 70%乙醇并直接用吸頭吸注6-8次混合均勻,吸取700 μl混合液加入到核酸純化柱中,蓋上管蓋,13000 rpm離心1分鐘。

7. 2 ml離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2 ml離心管中,吸取剩余的混合液加入到核酸純化柱中,13000 rpm離心1分鐘。

8. 2 ml離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2 ml離心管中,在核酸純化柱中加入500 μl Buffer WA,蓋上管蓋,13000 rpm離心1分鐘。

9. 每個反應(yīng)取5 μl DnaseⅠ、45 μl Buffer RDD配制柱上消化孵育液,勿棄吸頭,直接用移液器溫和地吹打幾次混合均勻。

10. 2 ml離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2 ml離心管中,向吸附柱中央加入50 μl步驟9配好的孵育液,室溫(20-30)放置15 min。

11. 加入500 μl Buffer WA,蓋上管蓋,12000 rpm離心30秒。

12. 2 ml離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2 ml離心管中,在核酸純化柱中加入600 μl Buffer WBR,蓋上管蓋,13000 rpm離心1分鐘。

13. 2 ml離心管中的濾液,將核酸純化柱置回到2 ml離心管中,14000 rpm離心1分鐘。

14. 2 ml離心管,將核酸純化柱置于一個潔凈的RNase-free1.5 ml離心管中,在純化柱的膜中央加入50 μl RNase-free Water,蓋上管蓋,室溫靜置1分鐘,13000 rpm離心1分鐘。

15. 棄純化柱,洗脫的RNA可立即用于各種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn);或者將RNA儲存于﹣70℃以下備用。

、實(shí)驗(yàn)結(jié)果:


Simgen高多糖多酚植物總RNA試劑盒-DNase Ⅰ柱上消化試劑盒-提取閩楠葉片RNA實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖

                                                       樣本12、3均來自同一株閩楠

2. 1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl提取到的RNA,電泳20 min,結(jié)果如下:

Simgen高多糖多酚植物總RNA試劑盒-DNase Ⅰ柱上消化試劑盒-提取閩楠葉片RNA電泳結(jié)果圖

五、討論與分析:

從結(jié)果上分析,Simgen高多糖多酚總RNA試劑盒能提取到閩楠葉片RNA,且RNA的得率相對T***gen產(chǎn)品有顯著提高。

客戶提出的“閩楠葉片經(jīng)過液氮研磨加入裂解液后會變得十分粘稠,像鼻涕狀,難以吸取上清”,這是由于閩楠葉片中含有較多的多糖(特別是淀粉類物質(zhì))衍生物的干擾,也證明了T***gen產(chǎn)品對于閩楠這一樣本RNA提取的局限性。

閩楠葉片由于纖維化較嚴(yán)重,且本身RNA的含量就相對較低,而Simgen高多糖多酚總RNA試劑盒操作步驟較為簡單,不存在上清吸不上來的問題,且RNA提取得率較高,完美適應(yīng)閩楠葉片RNA的提取。這時(shí)候選用Simgen高多糖多酚總RNA試劑盒提取RNA確實(shí)是省時(shí)省力的好辦法。