某天風(fēng)和日麗,我像往常一樣去公司上班,一到辦公室,銷(xiāo)售部的小伙伴就跑來(lái)向我抱怨:“小新啊,最近公司的凝膠回收試劑盒是不是質(zhì)檢不過(guò)關(guān)?我已經(jīng)接到好幾個(gè)投訴電話了?。?!”
我:“你說(shuō)啥!????怎么可能,出貨前都檢驗(yàn)了,沒(méi)有問(wèn)題?。。?!”
在小伙伴滿臉懷疑的表情下,我還是果斷的再檢測(cè)了一次,對(duì)比之后拿到了數(shù)據(jù),分分鐘甩了出來(lái)。
“不是吧?!85%的回收率客戶還嫌低?”
“可是客戶反映只有不到50%啊……”
為了實(shí)力證明產(chǎn)品的質(zhì)量,我決定去客戶的實(shí)驗(yàn)室走一趟。(這么近,不去多不好啊……)一上午時(shí)間搞定,回來(lái)之后小伙伴問(wèn)我怎么樣。為什么我們自己檢測(cè)的數(shù)據(jù)與客戶做出的結(jié)果差距如此之大?下面就由小新為大家解答:凝膠回收過(guò)程中有哪些容易被忽略的要點(diǎn)。
對(duì)照組采用無(wú)損失凝膠回收:(每組實(shí)驗(yàn)均有兩個(gè)重復(fù))
30μl+120μl凝膠作為樣品,然后通過(guò)正常的凝膠回收實(shí)驗(yàn)操作步驟(參照杭州新景生物試劑凝膠回收試劑盒說(shuō)明書(shū))。
第一組實(shí)驗(yàn)組:凝膠塊薄厚差異(每組實(shí)驗(yàn)均有兩個(gè)重復(fù))
客戶制膠相對(duì)較薄,實(shí)驗(yàn)室制得膠比較厚。這會(huì)兒估計(jì)會(huì)有小伙伴說(shuō)了,做那么厚的膠豈不是浪費(fèi)嗎?然而真的是浪費(fèi)嘛?我們來(lái)看圖片
(圖1:薄膠樣為仿客戶制膠)
(圖2:厚膠樣為實(shí)驗(yàn)室制膠)
從圖上我們可以很明顯的看出圖1的凝膠較薄,在跑樣孔附近有凸起,且整塊膠薄厚不均勻,圖2的膠明顯厚度均勻,沒(méi)有明顯的凸起凹陷。
那么為什么薄的膠會(huì)出現(xiàn)不均勻的現(xiàn)象呢?這在物理學(xué)上被稱之為“毛細(xì)作用”(毛細(xì)作用:是由分子表面張力引起的,由表面張力和分子與另一種分子之間的親和力引起的。以上來(lái)自百度百科)。
那么薄厚不同的膠,會(huì)對(duì)最終凝膠回收效率有什么影響呢?
我們?cè)趦蓧K厚薄不同的膠中添加了30μl同樣的DNA樣本,然后通過(guò)正常的凝膠回收實(shí)驗(yàn)操作步驟(參照杭州新景生物試劑凝膠回收試劑盒說(shuō)明書(shū)),得到了最終的一份實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。與此同時(shí),我們還進(jìn)行了第二組實(shí)驗(yàn)。
第二組實(shí)驗(yàn):跑膠時(shí)間對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響(每組實(shí)驗(yàn)均有兩個(gè)重復(fù))
點(diǎn)完樣,稍等片刻,我們?cè)賮?lái)觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
小新跑膠結(jié)束啦,為了效果更明顯,我們需要在側(cè)面觀察側(cè)面觀察DNA在凝膠中的狀態(tài):
圖3 :1號(hào)組厚膠電泳15分鐘效果
圖4:2號(hào)組厚膠電泳30分鐘效果
圖5:薄膠電泳15分鐘效果
圖6:3號(hào)組薄膠電泳30分鐘效果
通過(guò)對(duì)比圖3和圖4(或者圖5和圖6),均可看出,隨著電泳時(shí)間的加長(zhǎng),DNA條帶出現(xiàn)明顯的擴(kuò)散。如果凝膠比較厚,如圖4,大部分DNA還保留于凝膠中,但是相對(duì)較薄的凝膠,如圖6,估計(jì)得有一半的DNA都跑到電泳緩沖液中了。當(dāng)然,直觀感受沒(méi)有依據(jù)那么我們就用數(shù)據(jù)說(shuō)話,接下來(lái)繼續(xù)切膠回收。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:每組實(shí)驗(yàn)均有兩個(gè)重復(fù)(真相終于要浮出水面啦~)
1號(hào)、2號(hào)、3號(hào)實(shí)驗(yàn)組的平均回收效率分別為:85.8%、61.8%、37%(看看,這就是區(qū)別?。。。?。由此我們可以總結(jié)出:在凝膠回收的過(guò)程中盡量做相對(duì)厚一點(diǎn)的膠(為了回收效率就別在意那么一點(diǎn)點(diǎn)膠啦~),最大可能避免毛細(xì)作用導(dǎo)致膠體不均勻進(jìn)而影響回收效率;此外盡可能不要過(guò)長(zhǎng)時(shí)間的電泳,不然大部分的DNA都從凝膠膠體里跑到電泳緩沖液中的話,回收率當(dāng)然就低啦!回收過(guò)程中還要將凝膠塊融化完全,以避免堵塞純化柱。當(dāng)然這種小的細(xì)節(jié)相信大家都知道啦。好了今天的小新課堂就到這里了,下期再會(huì)!
杭州新景生物試劑開(kāi)發(fā)有限公司實(shí)驗(yàn)室
2016年1月26日
·20-30分鐘內(nèi)即可完成凝膠中DNA的回收·最高可以達(dá)到85%的回收效率·核酸純化柱無(wú)須平衡液處理,最大吸附30 μg DNA·溶液中所含的pH指示劑可直觀地判斷溶液中DNA與硅膠膜的最適宜結(jié)合條件·特別設(shè)計(jì)的純化柱,可用25 μl微量洗脫體積洗脫DNA·應(yīng)用:DNA測(cè)序、基因芯片分析、DNA連接與轉(zhuǎn)化、限制性酶切、標(biāo)記微注射、PCR、體外轉(zhuǎn)錄 查看產(chǎn)品