質(zhì)粒DNA的提取是分子生物實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的必備實(shí)驗(yàn)技能,市場(chǎng)中有許多質(zhì)粒DNA提取的試劑盒,但是你是否想過(guò)自己動(dòng)手制作一個(gè)質(zhì)粒DNA試劑盒呢?這次就由小編來(lái)教大家怎樣利用實(shí)驗(yàn)室常用資源來(lái)制作一個(gè)高純高效的柱純化質(zhì)粒DNA試劑盒。
第一,所在實(shí)驗(yàn)室必須擁有這些常用試劑:葡萄糖、Tris、HCl、EDTA、NaOH、SDS、乙酸鉀、冰乙酸、無(wú)水乙醇、異丙醇和超純水;
第二,利用這些試劑配制質(zhì)粒DNA提取所需的溶液:
堿裂解溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH8.0),10mM EDTA(pH8.0);
堿裂解溶液Ⅱ:0.2M NaOH,1%(m/v) SDS;
堿裂解溶液Ⅲ(100ml):5M 乙酸鉀 60ml,冰乙酸 11.5ml,純水28.5ml;
70%乙醇(50ml):35ml無(wú)水乙醇加15ml超純水
第三,我們可以去淘寶上購(gòu)買質(zhì)粒DNA純化柱(simgen,7002050)、RNase A(simgen,8001-001)。
所需的試劑都準(zhǔn)備齊了,接下來(lái),小編教大家怎樣利用這些資源來(lái)提取質(zhì)粒DNA:
1. 收集細(xì)菌,用1.5ml離心管收集1-5ml過(guò)夜培養(yǎng)的細(xì)菌;
2. 向離心管中加入250μl堿裂解溶液Ⅰ懸浮細(xì)菌(漩渦振蕩或移液器吹打);
3. 接著向溶液中加入250μl堿裂解溶液Ⅱ裂解細(xì)菌(溫和上下顛倒離心管數(shù)次);
4. 接著再向溶液中加入250μl堿裂解溶液Ⅲ中和溶液(溫和上下翻轉(zhuǎn)離心管數(shù)次);
5. 13000rpm高速離心10min,取上清至另一潔凈的離心管中;
6. 向溶液中加入275μl的異丙醇,混勻(溫和上下顛倒離心管數(shù)次或移液器吹打數(shù)次);
7. 將溶液全部轉(zhuǎn)至純化柱中(由于體積過(guò)大,溶液分兩次過(guò)柱);
8. 12000rpm高速離心30s,棄濾液;
9. 向純化柱中加入70%的乙醇;
10. 12000rpm高速離心30s,棄濾液;
11. 13000rpm高速離心2min,將純化柱置于潔凈的離心管;
12. 向純化柱中加入60μl超純水(雙蒸水),靜止2min;
13. 12000rpm高速離心30s,洗脫即可得到高純質(zhì)粒DNA。
注意事項(xiàng):
1. 此實(shí)驗(yàn)自制質(zhì)粒DNA試劑盒所用的純化柱和RNase A均是使用simgen的產(chǎn)品,倘若使用其他公司或其他序號(hào)的產(chǎn)品,可能會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)變化;
2. 在實(shí)驗(yàn)前將RNase A加到堿裂解溶液Ⅰ中,濃度是100μg/ml;
3. 加入堿裂解溶液Ⅱ后應(yīng)馬上翻轉(zhuǎn)且這步不能超過(guò)5min;
4. 異丙醇的體積不要太大,否則會(huì)有大量RNA殘留。
為了檢測(cè)自制的質(zhì)粒DNA試劑盒的性能,小編用1個(gè)快速質(zhì)粒DNA試劑盒產(chǎn)品(simgen)來(lái)做對(duì)照,所得的質(zhì)粒DNA的詳細(xì)OD值見(jiàn)下表:
編號(hào) | Abs260 | Abs280 | Abs230 | 260/230 | 260/280 | 濃度(ng/μl) |
1 | 6.536 | 3.576 | 3.045 | 2.15 | 1.83 | 326.81 |
2 | 6.134 | 3.358 | 2.893 | 2.12 | 1.83 | 306.70 |
3 | 6.024 | 3.278 | 2.656 | 2.27 | 1.84 | 301.20 |
4 | 6.675 | 3.607 | 3.016 | 2.21 | 1.85 | 333.73 |
1、2為對(duì)照試劑盒提取得到的質(zhì)粒DNA,3、4為自制試劑盒提取得到的質(zhì)粒DNA。
電泳結(jié)果圖:
從OD值和電泳圖可以看出,自制的質(zhì)粒DNA試劑盒所提取的DNA在濃度上和RNA殘留量都和對(duì)照的質(zhì)粒DNA試劑盒相似,并無(wú)明顯的差異,而且自制的試劑盒所提取的DNA的鹽分殘留更少。
好了,今天的新景生物實(shí)驗(yàn)室:分子生物百科就到這里了。大家覺(jué)得感興趣的話,可以自己動(dòng)手試試哦,我們下期再見(jiàn)?。?/span>
2016年3月23日
新景生物實(shí)驗(yàn)室
廣泛用來(lái)去除DNA樣品中的RNA。 查看產(chǎn)品
·國(guó)產(chǎn)膜及塑料材質(zhì)組裝,無(wú)需平衡液處理,可直接使用·2-10 kb 質(zhì)粒 DNA 飽和結(jié)合能力大于 25 μg·極其穩(wěn)定的 DNA 吸附性能,常溫(0-30℃)放置兩年無(wú)使用性能降低現(xiàn)象·可配合各個(gè)不同廠家的核酸純化試劑使用·可用于離心機(jī)或負(fù)壓裝置上的操作 查看產(chǎn)品