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DIY制作質(zhì)粒DNA試劑盒

作者:新景實(shí)驗(yàn)室
版權(quán)說(shuō)明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請(qǐng)標(biāo)注出處和本文鏈接

質(zhì)粒DNA的提取是分子生物實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的必備實(shí)驗(yàn)技能,市場(chǎng)中有許多質(zhì)粒DNA提取的試劑盒,但是你是否想過(guò)自己動(dòng)手制作一個(gè)質(zhì)粒DNA試劑盒呢?這次就由小編來(lái)教大家怎樣利用實(shí)驗(yàn)室常用資源來(lái)制作一個(gè)高純高效的柱純化質(zhì)粒DNA試劑盒。

第一,所在實(shí)驗(yàn)室必須擁有這些常用試劑:葡萄糖、Tris、HCl、EDTA、NaOHSDS、乙酸鉀、冰乙酸、無(wú)水乙醇、異丙醇和超純水;

第二,利用這些試劑配制質(zhì)粒DNA提取所需的溶液:

堿裂解溶液Ⅰ:50mM葡萄糖,25mM Tris-HClpH8.0),10mM EDTApH8.0;

堿裂解溶液Ⅱ:0.2M NaOH,1%m/v SDS;

堿裂解溶液Ⅲ(100ml):5M 乙酸鉀 60ml,冰乙酸  11.5ml,純水28.5ml;

70%乙醇(50ml):35ml無(wú)水乙醇加15ml超純水

    第三,我們可以去淘寶上購(gòu)買質(zhì)粒DNA純化柱(simgen,7002050、RNase Asimgen,8001-001。

所需的試劑都準(zhǔn)備齊了,接下來(lái),小編教大家怎樣利用這些資源來(lái)提取質(zhì)粒DNA

1. 收集細(xì)菌,用1.5ml離心管收集1-5ml過(guò)夜培養(yǎng)的細(xì)菌;

2. 向離心管中加入250μl堿裂解溶液Ⅰ懸浮細(xì)菌(漩渦振蕩或移液器吹打);

3. 接著向溶液中加入250μl堿裂解溶液Ⅱ裂解細(xì)菌(溫和上下顛倒離心管數(shù)次);

4. 接著再向溶液中加入250μl堿裂解溶液Ⅲ中和溶液(溫和上下翻轉(zhuǎn)離心管數(shù)次);

5. 13000rpm高速離心10min,取上清至另一潔凈的離心管中;

6. 向溶液中加入275μl的異丙醇,混勻(溫和上下顛倒離心管數(shù)次或移液器吹打數(shù)次);

7. 將溶液全部轉(zhuǎn)至純化柱中(由于體積過(guò)大,溶液分兩次過(guò)柱);

8. 12000rpm高速離心30s,棄濾液;

9. 向純化柱中加入70%的乙醇;

10. 12000rpm高速離心30s,棄濾液;

11. 13000rpm高速離心2min,將純化柱置于潔凈的離心管;

12. 向純化柱中加入60μl超純水(雙蒸水),靜止2min;

13. 12000rpm高速離心30s,洗脫即可得到高純質(zhì)粒DNA。

注意事項(xiàng):

1. 此實(shí)驗(yàn)自制質(zhì)粒DNA試劑盒所用的純化柱和RNase A均是使用simgen的產(chǎn)品,倘若使用其他公司或其他序號(hào)的產(chǎn)品,可能會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)變化;

2. 在實(shí)驗(yàn)前將RNase A加到堿裂解溶液Ⅰ中,濃度是100μg/ml;

3. 加入堿裂解溶液Ⅱ后應(yīng)馬上翻轉(zhuǎn)且這步不能超過(guò)5min;

4. 異丙醇的體積不要太大,否則會(huì)有大量RNA殘留。

    為了檢測(cè)自制的質(zhì)粒DNA試劑盒的性能,小編用1個(gè)快速質(zhì)粒DNA試劑盒產(chǎn)品(simgen)來(lái)做對(duì)照,所得的質(zhì)粒DNA的詳細(xì)OD值見(jiàn)下表:

編號(hào)

Abs260

Abs280

Abs230

260/230

260/280

濃度(ng/μl

1

6.536

3.576

3.045

2.15

1.83

326.81

2

6.134

3.358

2.893

2.12

1.83

306.70

3

6.024

3.278

2.656

2.27

1.84

301.20

4

6.675

3.607

3.016

2.21

1.85

333.73

1、2為對(duì)照試劑盒提取得到的質(zhì)粒DNA3、4為自制試劑盒提取得到的質(zhì)粒DNA。

電泳結(jié)果圖:

OD值和電泳圖可以看出,自制的質(zhì)粒DNA試劑盒所提取的DNA在濃度上和RNA殘留量都和對(duì)照的質(zhì)粒DNA試劑盒相似,并無(wú)明顯的差異,而且自制的試劑盒所提取的DNA的鹽分殘留更少。

好了,今天的新景生物實(shí)驗(yàn)室:分子生物百科就到這里了。大家覺(jué)得感興趣的話,可以自己動(dòng)手試試哦,我們下期再見(jiàn)?。?/span>

                                                2016323

                                                新景生物實(shí)驗(yàn)室