一、材料:
1. 樣品:送檢尾部組織樣本由客戶提供。
2. 動物組織DNA試劑盒(Simgen,Cat.No.3101050)
3. PCR擴(kuò)增試劑、引物、探針為杭州新景生物試劑開發(fā)有限公司自配或委托上海生工生物技術(shù)有限公司合成。
4. PCR儀:ABI PRISM® 7500 Sequence DeteCtion System
5. 離心機(jī):Thermo Biofuge pico
二、方法:
1. 用Simgen動物組織DNA試劑盒分離純化樣本中的DNA。
2. 按下列組分配制PCR檢測試劑( 40 μl反應(yīng)體系):
Master Mix(2×) 20.0 μl
上游引物FP 1.0 μl
下游引物RP 1.0 μl
探針Probe 0.5 μl
50× ROX 0.8μl
ddH2O 11.7 μl
向每個PCR反應(yīng)管中加入35 μl反應(yīng)混合液,再加入5μl分離純化的DNA進(jìn)行qPCR檢測。
注:陽性對照用實驗室保藏的小鼠肌肉DNA作為模板,陰性對照用ddH2O作為模板。
3. PCR循環(huán)條件設(shè)置: 95℃ 1 min→40×(95℃ 15s→60℃ 30s)
三、結(jié)果判定:
1.有效性原則
陰性對照:無FAM熒光信號檢出,未出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線。
陽性對照:有FAM熒光信號檢出,并出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線。
以上要求必須同時滿足,否則本次檢測無效。
結(jié)果:
1. 送檢樣本中的尾部組織DNA通過鼠的特異性熒光探針擴(kuò)增檢測呈陽性,判斷樣本的物種為鼠。
2. 結(jié)果分析:
1) 本次尾部組織樣本提取了兩管DNA,編號為Sample 1和Sample 2,經(jīng)PCR擴(kuò)增均為陽性,Ct值分別為16.105和16.524,陽性對照的Ct值分別為16.358和16.596,陰性對照未起線。
2) 從樣本DNA電泳發(fā)現(xiàn),樣本的DNA保存較為完整,應(yīng)該是尾部組織水分少,腐敗情況不嚴(yán)重。
送檢動物尾部組織樣本的Ct值報告:
送檢動物尾部組織樣本的熒光定量PCR擴(kuò)增曲線:
送檢動物尾部組織樣本DNA電泳圖:
如圖所示,其中M為DL2000Marker, 泳道1、2為送檢樣本DNA,泳道3、4是實驗室保藏的小鼠肌肉組織DNA。